中美倡議啟動“地球生物基因組計劃”

　　在美國斯密森尼生物多樣性基因組學(xué)項目組與中國華大基因公司近日聯(lián)合主辦的生物基因組學(xué)會議（BioGenomics2017）閉幕論壇上，加州大學(xué)戴維斯分?；蚪M學(xué)家哈瑞斯·萊文等人和華大基因生物學(xué)家張國捷等組成的科研團(tuán)隊聯(lián)合倡議，全球科學(xué)家合作開啟另一項與人類基因組計劃（HGP）類似的項目——地球生物基因組計劃（EBP），對地球上所有真核生物進(jìn)行測序。

　　據(jù)《科學(xué)》雜志官網(wǎng)報道，EBP計劃大約兩年前第一次提出，將著重對包括所有植物、動物和單細(xì)胞生物在內(nèi)的真核生物群體進(jìn)行測序。倡議團(tuán)隊估計，得益于測序技術(shù)的進(jìn)步和成本下降，可能只需10年時間以及與HGP相當(dāng)?shù)馁M(fèi)用（約27億美元），就能完成對全部真核生物的測序。

　　現(xiàn)有EBP框架大約分三步完成：第一步，為9000個真核生物科中的每科選出一個代表進(jìn)行DNA測序，獲得的參考基因組要與人類基因組相當(dāng)或更好；第二步，對15萬到20萬個真核生物屬中每個屬選取一個物種測序，詳細(xì)程度不需達(dá)到第一步的標(biāo)準(zhǔn)；第三步，對150萬個真核生物物種進(jìn)行粗略性測序。

　　項目倡議人員表示，EBP已經(jīng)取得良好開端，好幾個測序項目已經(jīng)啟動，包括為1萬種脊椎動物進(jìn)行基因組測序的基因組10K項目、破譯5000種節(jié)肢動物基因組的i5K項目、為1萬多種禽類物種測序基因組的B10K項目等。“我們就是要把EBP打造成‘戰(zhàn)斗機(jī)中的戰(zhàn)斗機(jī)’。”萊文說。

　　在會議上，中國華大基因和英國韋爾科姆基金會桑格研究所等基因組學(xué)領(lǐng)頭企業(yè)，表明了積極參與的立場，但EBP項目目前仍面臨重大挑戰(zhàn)：一是因生物多樣性問題，只有更多發(fā)展中國家參與并開展更加國際化的合作，該項目才能最終成型；二是制定高質(zhì)量測序和保存有機(jī)體樣本的標(biāo)準(zhǔn)，其中因現(xiàn)有博物館動植物樣品的保存方式不符合要求，或需要大量的野外采集樣品，這可能耗費(fèi)很大成本。