蓮遺傳連鎖圖譜研究取得進(jìn)展
遺傳連鎖圖譜是研究植物基因組結(jié)構(gòu)、進(jìn)化的有力工具,是基因定位、克隆和分子標(biāo)記輔助育種的重要基礎(chǔ)。但作為被子植物中起源最早的植物之一,且素有“活化石”之稱的蓮,其基因組學(xué)研究卻明顯滯后。因此,構(gòu)建蓮遺傳連鎖圖譜有助于蓮基因組學(xué)研究的快速發(fā)展,為蓮重要經(jīng)濟(jì)性狀的分離和克隆提供依據(jù),從而有利于進(jìn)一步探索和充分利用蓮的觀賞、食用和藥用價(jià)值。
中科院武漢植物園水生植物資源學(xué)科組首先掃描了中國(guó)古代蓮基因組序列,發(fā)現(xiàn)了86,089個(gè)SSR位點(diǎn),其中73,246個(gè)SSR位點(diǎn)可用于開(kāi)發(fā)SSR引物。然后以亞洲蓮品種“中國(guó)古代蓮”和美洲黃蓮品種“AL1”雜交F1群體為材料,根據(jù)中國(guó)古代蓮基因組序列信息開(kāi)發(fā)的部分SSR分子標(biāo)記(500對(duì))分別構(gòu)建了“中國(guó)古代蓮”和“AL1”的遺傳連鎖圖譜。由于“中國(guó)古代蓮”的基因組雜合度比較低,此圖譜僅包含7個(gè)連鎖群,有47個(gè)標(biāo)記,圖譜長(zhǎng)度為365.67 cM。“AL1”圖譜包含11個(gè)連鎖群,有177個(gè)分子標(biāo)記,圖譜長(zhǎng)度為524.51 cM。這是首次報(bào)道蓮的遺傳連鎖圖譜,為蓮基因組學(xué)研究奠定了良好基礎(chǔ),加快了蓮重要基因定位、克隆和分子標(biāo)記輔助育種的進(jìn)程。
美洲黃蓮“AL1”遺傳連鎖圖譜
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